Hi Andreas,<br><br>The ndft files are N-dimensional scalar fields in binary format, representing the statistical density of various side-chain conformations.  See <a href="http://kinemage.biochem.duke.edu/databases/rotamer.php">http://kinemage.biochem.duke.edu/databases/rotamer.php</a>, especially the Son Of download and its README file (<a href="http://kinemage.biochem.duke.edu/databases/READMEforTop500angleData.html">http://kinemage.biochem.duke.edu/databases/READMEforTop500angleData.html</a>).  The binary format is straightforward but made up, you'd have to read the code in that download to reverse engineer the format, I don't remember it any more  :)  I think I called that package Silk, the one that contains the reader/writer code.<br>
<br>The files are used by tools for rebuilding protein structure, to judge how (un)favorable a proposed conformation is.  Without them, those tools won't work, though other parts of KiNG may (or may not, depends how good my error handling code was).<br>
<br>Best,<br>Ian<br><br><div class="gmail_quote">On Fri, May 4, 2012 at 9:37 AM, Andreas Tille <span dir="ltr"><<a href="mailto:tille@debian.org" target="_blank">tille@debian.org</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
Hi,<br>
<br>
our ftpmasters checked my upload of the king Debian package and had the<br>
following question:<br>
<br>
   While checking your package I found some files of a type I don't know.<br>
   What are ndft files (found in<br>
   king-2.20.110601/chiropraxis/resource/chiropraxis/rotarama/*)?  How would I edit them?<br>
<br>
The background is that we can not provide binary data without source<br>
inside Debian if the user hase no chance (not even in theory) to change<br>
these.<br>
<br>
In how far are these data needed to run King?<br>
<br>
Kind regards and thanks for providing King as Free Software<br>
<span class="HOEnZb"><font color="#888888"><br>
     Andreas.<br>
<br>
--<br>
<a href="http://fam-tille.de" target="_blank">http://fam-tille.de</a><br>
</font></span></blockquote></div><br>