<div dir="ltr"><div>It still crashes for me. The output is below: </div><div>"</div><div>PyMOL(TM) Molecular Graphics System, Version 1.7.2.1.</div><div> Copyright (c) Schrodinger, LLC.</div><div> All Rights Reserved.</div><div> </div><div>    Created by Warren L. DeLano, Ph.D. </div><div> </div><div>    PyMOL is user-supported open-source software.  Although some versions</div><div>    are freely available, PyMOL is not in the public domain.</div><div> </div><div>    If PyMOL is helpful in your work or study, then please volunteer </div><div>    support for our ongoing efforts to create open and affordable scientific</div><div>    software by purchasing a PyMOL Maintenance and/or Support subscription.</div><div><br></div><div>    More information can be found at "<a href="http://www.pymol.org">http://www.pymol.org</a>".</div><div> </div><div>    Enter "help" for a list of commands.</div><div>    Enter "help <command-name>" for information on a specific command.</div><div><br></div><div> Hit ESC anytime to toggle between text and graphics.</div><div><br></div><div> Detected OpenGL version 2.0 or greater. Shaders available.</div><div> Detected GLSL version 1.30.</div><div> OpenGL graphics engine:</div><div>  GL_VENDOR:   VMware, Inc.</div><div>  GL_RENDERER: Gallium 0.4 on llvmpipe (LLVM 3.5, 256 bits)</div><div>  GL_VERSION:  3.0 Mesa 10.3.2</div><div> Detected 2 CPU cores.  Enabled multithreaded rendering.</div><div>PyMOL>fetch 3iol</div><div> please wait ...</div><div>HEADER    SIGNALING PROTEIN/SIGNALING PROTEIN     14-AUG-09   3IOL</div><div>TITLE     CRYSTAL STRUCTURE OF GLUCAGON-LIKE PEPTIDE-1 IN COMPLEX WITH THE</div><div>TITLE    2 EXTRACELLULAR DOMAIN OF THE GLUCAGON-LIKE PEPTIDE-1 RECEPTOR</div><div>COMPND    MOL_ID: 1;</div><div>COMPND   2 MOLECULE: GLUCAGON-LIKE PEPTIDE 1 RECEPTOR;</div><div>COMPND   3 CHAIN: A;</div><div>COMPND   4 FRAGMENT: N-TERMINAL EXTRACELLULAR DOMAIN, UNP RESIDUES 24-145;</div><div>COMPND   5 SYNONYM: GLP-1 RECEPTOR, GLP-1-R, GLP-1R;</div><div>COMPND   6 ENGINEERED: YES;</div><div>COMPND   7 MOL_ID: 2;</div><div>COMPND   8 MOLECULE: GLUCAGON;</div><div>COMPND   9 CHAIN: B;</div><div>COMPND  10 FRAGMENT: UNP RESIDUES 98-128;</div><div>COMPND  11 SYNONYM: GLP-1, GLUCAGON-LIKE PEPTIDE 1, GLICENTIN, GLICENTIN-RELATED</div><div>COMPND  12 POLYPEPTIDE;</div><div>COMPND  13 ENGINEERED: YES</div><div> ObjectMolecule: Read secondary structure assignments.</div><div> ObjectMolecule: Read crystal symmetry information.</div><div> Symmetry: Found 4 symmetry operators.</div><div> CmdLoad: "./3iol.pdb" loaded as "3iol".</div><div>Segmentation fault</div><div><br></div><div>"</div><div><br></div><div><br></div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Thu, Apr 30, 2015 at 4:40 AM, Michael Banck <span dir="ltr"><<a href="mailto:mbanck@debian.org" target="_blank">mbanck@debian.org</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">tags 783653 +unreproducible<br>
thanks<br>
<br>
Hi,<br>
<span class=""><br>
On Tue, Apr 28, 2015 at 02:57:55PM -0400, nbx909 wrote:<br>
> Package: pymol<br>
> Version: 1.7.2.1-1<br>
> Severity: important<br>
><br>
> Dear Maintainer,<br>
><br>
> Loading a pdb manually or through the fetch command immediately results in a<br>
> segmentation fault and pymol closes.<br>
<br>
</span>I tried to fetch the molecule of the month ("fetch 3iol"), and had no<br>
issues.<br>
<br>
Can you attach a .pdb file with crashed for you? Also, please add the<br>
output you get when you start pymol from a terminal.<br>
<br>
<br>
Cheers,<br>
<br>
Michael<br>
</blockquote></div><br></div>