Hi all,<div><br></div><div>I am new (to neurodebian, to virtual machines, to FSL), so please bear with me and thanks in advance for any help.</div><div><br></div><div>Yesterday I got Neurodebian working as a 64-bit virtual machine on my macbook pro core2duo running 10.5.8. I installed FSL 4.1.8, was able to access the shared folder and files on my mac, and successfully ran a simple analysis on a subject's nifti data (BET extraction, FLIRT, FEAT).</div>
<div><br></div><div>Today, with nothing changed on my system, I am not so lucky. Here are the errors:</div><div><br></div><div>running FSL and then <u>BET</u> from the terminal (with the GUI), BET tries to work on a .nii file within a /mnt/host/FSL/ subfolder, but spits out:</div>
<div><br><div><b>/usr/share/fsl/4.1/bin/bet2: error while loading shared libraries: libmeshclass.so: cannot open shared object file: No such file or directory</b></div><div><b>Finished</b></div></div><div><br></div><div>trying to run <u>FEAT</u> on BOLD data, I get the following in a popup window, immediately after trying to load the 4D data (which is located in the same shared directory as the anatomical file mentioned above):</div>
<div><br></div><div><div><b>child process exited abnormally</b></div><div><b>child process exited abnormally</b></div><div><b>    while executing</b></div><div><b>"exec sh -c "${FSLDIR}/bin/fslnvols $thefile 2> /dev/null" "</b></div>
<div><b>    (procedure "feat5:updateimageinfo" line 10)</b></div><div><b>    invoked from within</b></div><div><b>"feat5:updateimageinfo $w $i 1"</b></div><div><b>    (procedure "feat5:multiple_check" line 56)</b></div>
<div><b>    invoked from within</b></div><div><b>"feat5:multiple_check .r 0 1 1 d"</b></div><div><b>    invoked from within</b></div><div><b>".dialog1.cancel invoke"</b></div><div><b>    ("uplevel" body line 1)</b></div>
<div><b>    invoked from within</b></div><div><b>"uplevel #0 [list $w invoke]"</b></div><div><b>    (procedure "tk::ButtonUp" line 22)</b></div><div><b>    invoked from within</b></div><div><b>"tk::ButtonUp .dialog1.cancel"</b></div>
<div><b>    (command bound to event)</b></div></div><div><br></div><div><br></div><div>I'm a linux newbie, so I have no idea how to proceed. I'm particularly confused as to why something that worked yesterday is now yielding errors, as I haven't changed anything with the system. I followed the VMWare setup instructions on the neurodebian site. Any help is greatly appreciated. This is my first time using a mailing list (I first tried and failed to find an official web forum), so hopefully I'm sending this to the correct place.</div>
<div><br></div><div>Best and thanks,</div><div>Mike Klein</div><div>McGill University</div><div><br></div>