<p>Hey,</p>
<p>You're the second user to report this. Sadly, the first one vanished. Could you provide my with a smallish dataset and a commandline call to reproduce the problem? That would help me a lot to track this down.</p>
<p>Thanks,</p>
<p>Michael</p>
<div class="gmail_quote">On Mar 27, 2012 9:45 PM, "Antti Korvenoja" <<a href="mailto:antti.korvenoja@helsinki.fi">antti.korvenoja@helsinki.fi</a>> wrote:<br type="attribution"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
Hi!<br>
<br>
I'm probably having problems with condor configuration. I set up a<br>
personal (single host, multicore) configuration with debconf on Debian<br>
wheezy. When I run FSL analysis (FEAT or MELODIC) with<br>
FSLPARALLEL=condor the processing does not progress beyond submitting<br>
jobs (fsl_sub calls). I can see condor processes are running but none of<br>
the FSL subprograms (e.g. flirt) are running. No error output is<br>
generated on fsl log. The analysis job does not progress. With<br>
FSLPARALLEL=0 the same job is finished without problems (sadly using<br>
only one core).<br>
<br>
Any ideas what might be wrong? Does the grid-engine package need to be<br>
installed as well?<br>
<br>
Thank you,<br>
<br>
Antti<br>
<br>
<br>
_______________________________________________<br>
Neurodebian-users mailing list<br>
<a href="mailto:Neurodebian-users@lists.alioth.debian.org">Neurodebian-users@lists.alioth.debian.org</a><br>
<a href="http://lists.alioth.debian.org/cgi-bin/mailman/listinfo/neurodebian-users" target="_blank">http://lists.alioth.debian.org/cgi-bin/mailman/listinfo/neurodebian-users</a><br>
</blockquote></div>