<html xmlns:v="urn:schemas-microsoft-com:vml" xmlns:o="urn:schemas-microsoft-com:office:office" xmlns:w="urn:schemas-microsoft-com:office:word" xmlns:m="http://schemas.microsoft.com/office/2004/12/omml" xmlns="http://www.w3.org/TR/REC-html40"><head><meta http-equiv=Content-Type content="text/html; charset=us-ascii"><meta name=Generator content="Microsoft Word 12 (filtered medium)"><style><!--
/* Font Definitions */
@font-face
        {font-family:"Cambria Math";
        panose-1:2 4 5 3 5 4 6 3 2 4;}
@font-face
        {font-family:Calibri;
        panose-1:2 15 5 2 2 2 4 3 2 4;}
/* Style Definitions */
p.MsoNormal, li.MsoNormal, div.MsoNormal
        {margin:0cm;
        margin-bottom:.0001pt;
        font-size:11.0pt;
        font-family:"Calibri","sans-serif";}
a:link, span.MsoHyperlink
        {mso-style-priority:99;
        color:blue;
        text-decoration:underline;}
a:visited, span.MsoHyperlinkFollowed
        {mso-style-priority:99;
        color:purple;
        text-decoration:underline;}
span.E-MailFormatvorlage17
        {mso-style-type:personal-compose;
        font-family:"Calibri","sans-serif";
        color:windowtext;}
.MsoChpDefault
        {mso-style-type:export-only;}
@page WordSection1
        {size:612.0pt 792.0pt;
        margin:70.85pt 70.85pt 2.0cm 70.85pt;}
div.WordSection1
        {page:WordSection1;}
--></style><!--[if gte mso 9]><xml>
<o:shapedefaults v:ext="edit" spidmax="1026" />
</xml><![endif]--><!--[if gte mso 9]><xml>
<o:shapelayout v:ext="edit">
<o:idmap v:ext="edit" data="1" />
</o:shapelayout></xml><![endif]--></head><body lang=DE link=blue vlink=purple><div class=WordSection1><p class=MsoNormal>Dear colleagues,<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US>I have a somehow strange problem with dcm2nii (Version 12 12 2012) which I installed with  MRICron from the NeuroDebian source. When running it on an Ubuntu 12.04 64bit machine it does not convert the correct number of files (from a  192 slices MPRage, Siemens Trio IMA format, it finds and converts 129 slices and from a 42 directions DTI data set it identifies 28 files). However, when using exactly the same dcm2nii version on a CentOs 6.3 64bit machine, everything works perfect. Since I use a mounted fileserver directory, the files used in both cases are even physically the same. Is there anybody out who experienced the same problem or might even know a solution? <o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US>Many thanks to Michael Hanke who answered my inquiry to him and proposed to ask the List.<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US><o:p> </o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US>Best,<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US><o:p> </o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US>Peter<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US><o:p> </o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US style='font-size:9.0pt;color:#A6A6A6'>--<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US style='font-size:9.0pt;color:#A6A6A6'>Peter Kirsch, PhD<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US style='font-size:9.0pt;color:#A6A6A6'>Professor of Clinical Psychology<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US style='font-size:9.0pt;color:#A6A6A6'>Head, Department of Clinical Psychology<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US style='font-size:9.0pt;color:#A6A6A6'>Central Institute of Mental Health and<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US style='font-size:9.0pt;color:#A6A6A6'>Mannheim School of Medicine<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US style='font-size:9.0pt;color:#A6A6A6'>University of Heidelberg<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US><o:p> </o:p></span></p></div></body></html>