<html>
  <head>
    <meta content="text/html; charset=ISO-8859-1"
      http-equiv="Content-Type">
  </head>
  <body text="#000000" bgcolor="#FFFFFF">
    Dear Meng,<br>
    <br>
    I encountered a similar problem under a virtual machine before. I
    think this error occurs due to some problems with access to the
    shared folders. For me it worked after copying the nifti-files to a
    local folder inside the virtual machine.<br>
    However, maybe somebody who is more familiar with the VM-environment
    might provide some solution which allows running the analyses with
    files still located in a shared folder.<br>
    <br>
    Best,<br>
    René<br>
    <br>
    <div class="moz-cite-prefix">On 07/15/2014 12:46 AM, Meng Liang
      wrote:<br>
    </div>
    <blockquote cite="mid:DUB125-W9568BADF625CDA80BCCEA8D00A0@phx.gbl"
      type="cite">
      <style><!--
.hmmessage P
{
margin:0px;
padding:0px
}
body.hmmessage
{
font-size: 12pt;
font-family:Calibri
}
--></style>
      <div dir="ltr">Dear experts,
        <div><br>
        </div>
        <div>I just installed the latest version of Neurodebian on a
          Windows7 PC (64bit) (on virtual box) and the FSL5.0-complete
          on it. The installation process went well without any error
          message. However, when I try to use Feat, I got two problems:</div>
        <div><br>
        </div>
        <div>1. After FSL5.0 (complete version) installation, it appears
          under 'Application Menu->Education'. If I launch FSL5.0
          from here, I can specify my Feat model without a problem using
          Feat GUI (I also saved it as 'design.fsf'). But I noticed that
          the host folder appears as '/media/sf_host/' instead of
          '/mnt/host'. After clicking Go, a 'S01.feat' folder was
          created and there is a file called 'feat1' under folder
          'S01.feat/logs'. The message in this file is the following:</div>
        <div>========</div>
        <div>/bin/cp /tmp/feat_AstyoC.fsf design.fsf</div>
        <div><br>
        </div>
        <div>/usr/share/fsl/5.0/bin/feat_model design </div>
        <div><br>
        </div>
        <div>mkdir .files;cp /usr/share/fsl/5.0/doc/fsl.css .files;ln -s
          /usr/share/fsl/5.0/doc/images .files/images</div>
        <div><br>
        </div>
        <div>FATAL ERROR ENCOUNTERED </div>
        <div>========</div>
        <div><br>
        </div>
        <div>2. If I launch Feat GUI by typing 'Feat' in a terminal
          after cd to the folder '/mnt/host/S01', I can successfully
          select the 4D file. However, when I try to specify the output
          directory after clicking the browse button, I got the
          following error message:</div>
        <div>=========</div>
        <div>
          <div>couldn't read directory "/mnt/host/S01/ /": not a
            directory</div>
          <div>couldn't read directory "/mnt/host/S01/ /": not a
            directory</div>
          <div>    while executing</div>
          <div>"glob -nocomplain * $dirpatmatch "</div>
          <div>    (procedure "feat_<a class="moz-txt-link-freetext" href="file:LoadDirIntoLists">file:LoadDirIntoLists</a>" line 28)</div>
          <div>    invoked from within</div>
          <div>"feat_<a class="moz-txt-link-freetext" href="file:LoadDirIntoLists">file:LoadDirIntoLists</a> w0"</div>
          <div>    (procedure "feat_<a class="moz-txt-link-freetext" href="file:setup_dialog">file:setup_dialog</a>" line 106)</div>
          <div>    invoked from within</div>
          <div>"feat_<a class="moz-txt-link-freetext" href="file:setup_dialog">file:setup_dialog</a> $path $output $var_filhis
            $var_selhis [namespace current] $filetypes $title $command
            $dirasfile"</div>
          <div>    (procedure "FileEntry::OpenFile" line 18)</div>
          <div>    invoked from within</div>
          <div>"FileEntry::OpenFile .r.nb.fdata.outputdir"</div>
          <div>    ("uplevel" body line 1)</div>
          <div>    invoked from within</div>
          <div>"uplevel \#0 $cmd"</div>
          <div>    (procedure "Button::_release" line 19)</div>
          <div>    invoked from within</div>
          <div>"Button::_release .r.nb.fdata.outputdir.b"</div>
          <div>    (command bound to event)</div>
        </div>
        <div>===========</div>
        <div>I got the same error message if I cd to /media/sf_host in a
          terminal and then launch Feat GUI.</div>
        <div><br>
        </div>
        <div>Any help would be very much appreciated. </div>
        <div><br>
        </div>
        <div>Best,<br>
          Meng</div>
      </div>
      <br>
      <fieldset class="mimeAttachmentHeader"></fieldset>
      <br>
      <pre wrap="">_______________________________________________
Neurodebian-users mailing list
<a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:Neurodebian-users@lists.alioth.debian.org">Neurodebian-users@lists.alioth.debian.org</a>
<a class="moz-txt-link-freetext" href="http://lists.alioth.debian.org/cgi-bin/mailman/listinfo/neurodebian-users">http://lists.alioth.debian.org/cgi-bin/mailman/listinfo/neurodebian-users</a></pre>
    </blockquote>
    <br>
  </body>
</html>