<div dir="ltr"><div><div>yes that did it. I am still getting an error about my 3D acceleration configuration being off, but that's for another time.<br><br></div>Thank you so much!<br><br></div>Devin<br></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Mon, Oct 26, 2015 at 10:28 AM, Yaroslav Halchenko <span dir="ltr"><<a href="mailto:debian@onerussian.com" target="_blank">debian@onerussian.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><span class=""><br>
On Mon, 26 Oct 2015, Devin Richard Bayly wrote:<br>
<br>
> Hello there,<br>
<br>
> Does anyone use nipype and MRtrix with their VM Neurodebian, and would you be<br>
> so good as to help me figure out what paths need being set in the .bashrc so<br>
> that nipype will be able to run commands like the MRConvert?<br>
<br>
</span>export PATH=/usr/lib/mrtrix/bin:$PATH<br>
<br>
?<br>
<span class="HOEnZb"><font color="#888888"><br>
--<br>
Yaroslav O. Halchenko<br>
Center for Open Neuroscience     <a href="http://centerforopenneuroscience.org" rel="noreferrer" target="_blank">http://centerforopenneuroscience.org</a><br>
Dartmouth College, 419 Moore Hall, Hinman Box 6207, Hanover, NH 03755<br>
Phone: <a href="tel:%2B1%20%28603%29%20646-9834" value="+16036469834">+1 (603) 646-9834</a>                       Fax: <a href="tel:%2B1%20%28603%29%20646-1419" value="+16036461419">+1 (603) 646-1419</a><br>
WWW:   <a href="http://www.linkedin.com/in/yarik" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.linkedin.com/in/yarik</a><br>
</font></span></blockquote></div><br></div>