Hi all,<br><br>I&#39;m using pynifti&#39;s NiftiImage to write a nifti file from a NumPy array. I am able to write nifti files fine from ndarrays ordered z,y,x. The problem is, when I display them in fslview, they&#39;re offset on the x axis - the brain is split in half (when displayed with the MNI152 standard space brain). This happens whether I write the array without any header updating or if I match the headers between the image I&#39;m creating and the MNI152 standard space image using UpdateFromDict. My best guess is that something with the sform is off but I&#39;m not certain. Any suggestions?<br>
<br>Thanks a lot,<br>Jesse Brown<br>