Here you go,<br><br>Dataset / float32 153 x 40656<br>uniq: 8 chunks 5 labels<br>stats: mean=-0.0255406 std=0.994264 var=0.98856 min=-6.94855 max=6.71638<br><br>Counts of labels in each chunk:<br>  chunks\labels 1.0 2.0 3.0 4.0 5.0<br>
                --- --- --- --- ---<br>      0.0        3   6   0   9   6<br>      1.0        3   0   6   3   6<br>      2.0        3   6   3   3   3<br>      3.0        0   6   9   0   6<br>      4.0        6   0   0   3   3<br>
      5.0        6   3   0   9   0<br>      6.0        6   6   3   6   0<br>      7.0        3   3   9   0   6<br><br>Summary per label across chunks<br>  label mean  std min max #chunks<br>   1    3.75 1.98  0   6     7<br>
   2    3.75 2.49  0   6     6<br>   3    3.75  3.6  0   9     5<br>   4    4.12 3.33  0   9     6<br>   5    3.75 2.49  0   6     6<br><br>Summary per chunk across labels<br>  chunk mean  std min max #labels<br>   0     4.8 3.06  0   9     4<br>
   1     3.6 2.24  0   6     4<br>   2     3.6  1.2  3   6     5<br>   3     4.2  3.6  0   9     3<br>   4     2.4 2.24  0   6     3<br>   5     3.6  3.5  0   9     3<br>   6     4.2  2.4  0   6     4<br>   7     4.2 3.06  0   9     4<br>
<br><br>Thanks,<br>Geethmala<br><br><div class="gmail_quote">On Tue, Feb 2, 2010 at 2:11 PM, Matthias Ekman <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:Matthias.Ekman@nf.mpg.de">Matthias.Ekman@nf.mpg.de</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;">
Hi,<br>
<br>
could you please post:<br>
print ds.summary()<br>
<br>
.. just to make sure, that there are samples belonging to class 3 :)<br>
<font color="#888888"><br>
<br>
Matthias<br>
</font><div><div></div><div class="h5"><br>
Geethmala wrote:<br>
&gt; No, I don&#39;t have a mix of them. They are all integer values.<br>
&gt;<br>
&gt; Thanks,<br>
&gt; Geethmala<br>
&gt;<br>
&gt; On Tue, Feb 2, 2010 at 1:59 PM, Yaroslav Halchenko &lt;<a href="mailto:debian@onerussian.com">debian@onerussian.com</a>&gt;wrote:<br>
&gt;<br>
&gt;&gt; it means that<br>
&gt;&gt;<br>
&gt;&gt;  Classifier LinearCSVMC(kernel_type=&#39;linear&#39;, svm_impl=&#39;C_SVC&#39;)<br>
&gt;&gt;  wasn&#39;t trained to classify labels Set([3.0]) present in testing<br>
&gt;&gt;  dataset. Make sure that you have not mixed order/names of the<br>
&gt;&gt;  arguments anywhere<br>
&gt;&gt;<br>
&gt;&gt; Also test if you don&#39;t have a mix of float and int labels in your<br>
&gt;&gt; datasets (as I remember you are manually composing those).<br>
&gt;&gt;<br>
&gt;&gt;<br>
&gt;&gt; On Tue, 02 Feb 2010, Geethmala wrote:<br>
&gt;&gt;<br>
&gt;&gt;&gt;    Hi,<br>
&gt;&gt;&gt;    I get the following warning when I run LinearCSVMC.<br>
&gt;&gt;&gt;    WARNING: Classifier LinearCSVMC(kernel_type=&#39;linear&#39;,<br>
&gt;&gt; svm_impl=&#39;C_SVC&#39;)<br>
&gt;&gt;&gt;    wasn&#39;t trained to classify labels Set([3.0]) present in testing<br>
&gt;&gt;&gt;    dataset. Make sure that you have not mixed order/names of the<br>
&gt;&gt; arguments<br>
&gt;&gt;&gt;    anywhere<br>
&gt;&gt;&gt;    What does this warning mean?<br>
&gt;&gt;&gt;    Thanks,<br>
&gt;&gt;&gt;    Geethmala<br>
&gt;&gt;&gt; _______________________________________________<br>
&gt;&gt;&gt; Pkg-ExpPsy-PyMVPA mailing list<br>
&gt;&gt;&gt; <a href="mailto:Pkg-ExpPsy-PyMVPA@lists.alioth.debian.org">Pkg-ExpPsy-PyMVPA@lists.alioth.debian.org</a><br>
&gt;&gt;&gt; <a href="http://lists.alioth.debian.org/mailman/listinfo/pkg-exppsy-pymvpa" target="_blank">http://lists.alioth.debian.org/mailman/listinfo/pkg-exppsy-pymvpa</a><br>
&gt;&gt;<br>
&gt;&gt; --<br>
&gt;&gt;                                  .-.<br>
&gt;&gt; =------------------------------   /v\  ----------------------------=<br>
&gt;&gt; Keep in touch                    // \\     (yoh@|www.)<a href="http://onerussian.com" target="_blank">onerussian.com</a><br>
&gt;&gt; Yaroslav Halchenko              /(   )\               ICQ#: 60653192<br>
&gt;&gt;                   Linux User    ^^-^^    [175555]<br>
&gt;&gt;<br>
&gt;&gt;<br>
&gt;&gt;<br>
&gt;&gt; _______________________________________________<br>
&gt;&gt; Pkg-ExpPsy-PyMVPA mailing list<br>
&gt;&gt; <a href="mailto:Pkg-ExpPsy-PyMVPA@lists.alioth.debian.org">Pkg-ExpPsy-PyMVPA@lists.alioth.debian.org</a><br>
&gt;&gt; <a href="http://lists.alioth.debian.org/mailman/listinfo/pkg-exppsy-pymvpa" target="_blank">http://lists.alioth.debian.org/mailman/listinfo/pkg-exppsy-pymvpa</a><br>
&gt;&gt;<br>
&gt;<br>
&gt;<br>
</div></div>&gt; ------------------------------------------------------------------------<br>
<div><div></div><div class="h5">&gt;<br>
&gt; _______________________________________________<br>
&gt; Pkg-ExpPsy-PyMVPA mailing list<br>
&gt; <a href="mailto:Pkg-ExpPsy-PyMVPA@lists.alioth.debian.org">Pkg-ExpPsy-PyMVPA@lists.alioth.debian.org</a><br>
&gt; <a href="http://lists.alioth.debian.org/mailman/listinfo/pkg-exppsy-pymvpa" target="_blank">http://lists.alioth.debian.org/mailman/listinfo/pkg-exppsy-pymvpa</a><br>
</div></div></blockquote></div><br>