<p>Hey,</p>
<p>could you give us some details about this perceived slowness, please. So far we found the performance quite comparable to a native installation. How much memory and cpus did you assign to the virtual machine?</p>
<p>Michael</p>
<div class="gmail_quote">On Oct 29, 2010 6:27 PM,  &lt;<a href="mailto:tbeck@artsci.wustl.edu">tbeck@artsci.wustl.edu</a>&gt; wrote:<br type="attribution">&gt; Yaroslav<br>&gt; <br>&gt; Thanks much for your fast helpful feedback. the debian virtual machine<br>
&gt; works well.  it runs a bit slow on my machine, but should work for the<br>&gt; time being.  Thanks again for the helpful feedback to a newbie.<br>&gt; <br>&gt; have a great weekend everybody,<br>&gt; Taylor<br>&gt; <br>
&gt; <br>&gt;&gt; On Fri, 29 Oct 2010, <a href="mailto:tbeck@artsci.wustl.edu">tbeck@artsci.wustl.edu</a> wrote:<br>&gt;&gt;&gt; python -c &#39;import nifti&#39; gave me the same error:<br>&gt;&gt;&gt; Import Error: No module named nifti<br>
&gt;&gt;<br>&gt;&gt; so, there is no nifti for this version/flavor of python you are using by<br>&gt;&gt; default ;)<br>&gt;&gt;<br>&gt;&gt;&gt; can you tell from this output what may have<br>&gt;&gt;&gt; gone wrong?<br>&gt;&gt; I bet it is exactly what I feared:<br>
&gt;&gt;<br>&gt;&gt;  P.S. Common problem on OSX is the hell of mixes of different pythons<br>&gt;&gt;  and corresponding modules installed via variety of methods (local,<br>&gt;&gt;  macports, etc) since there is no uniform one &quot;out of the box&quot;<br>
&gt;&gt;  installation mechanism, i.e. like on Debian ;-)  thus for the best<br>&gt;&gt;  experience we just advice users to use<br>&gt;&gt;  <a href="http://neuro.debian.net/vm.html">http://neuro.debian.net/vm.html</a>.<br>
&gt;&gt;<br>&gt;&gt;&gt; When I ran print mvpa.wtf(), I noticed a bunch of the externals don&#39;t<br>&gt;&gt;&gt; seem<br>&gt;&gt;&gt; to have installed properly (see below).  Is there a command to install<br>&gt;&gt;&gt; these individually manually?<br>
&gt;&gt;<br>&gt;&gt; get sources and follow each package installation instructions, which<br>&gt;&gt; most of the time something like<br>&gt;&gt;<br>&gt;&gt; python setup.py install<br>&gt;&gt;<br>&gt;&gt;<br>&gt;&gt; or once again -- forget about all this mess and use virtual machine with<br>
&gt;&gt; Debian and enjoy the paradise ;-)<br>&gt;&gt;<br>&gt;&gt; --<br>&gt;&gt;                                   .-.<br>&gt;&gt; =------------------------------   /v\  ----------------------------=<br>&gt;&gt; Keep in touch                    // \\     (yoh@|www.)<a href="http://onerussian.com">onerussian.com</a><br>
&gt;&gt; Yaroslav Halchenko              /(   )\               ICQ#: 60653192<br>&gt;&gt;                    Linux User    ^^-^^    [175555]<br>&gt;&gt;<br>&gt;&gt;<br>&gt;&gt;<br>&gt;&gt; _______________________________________________<br>
&gt;&gt; Pkg-ExpPsy-PyMVPA mailing list<br>&gt;&gt; <a href="mailto:Pkg-ExpPsy-PyMVPA@lists.alioth.debian.org">Pkg-ExpPsy-PyMVPA@lists.alioth.debian.org</a><br>&gt;&gt; <a href="http://lists.alioth.debian.org/mailman/listinfo/pkg-exppsy-pymvpa">http://lists.alioth.debian.org/mailman/listinfo/pkg-exppsy-pymvpa</a><br>
&gt;&gt;<br>&gt; <br>&gt; <br>&gt; <br>&gt; _______________________________________________<br>&gt; Pkg-ExpPsy-PyMVPA mailing list<br>&gt; <a href="mailto:Pkg-ExpPsy-PyMVPA@lists.alioth.debian.org">Pkg-ExpPsy-PyMVPA@lists.alioth.debian.org</a><br>
&gt; <a href="http://lists.alioth.debian.org/mailman/listinfo/pkg-exppsy-pymvpa">http://lists.alioth.debian.org/mailman/listinfo/pkg-exppsy-pymvpa</a><br></div>