<div dir="ltr">Hi Michael,<br><br>I checked the version and looks like:<br><br><div style="margin-left:40px">>>> scipy.version.version<br>'0.10.1'<br></div><br>I downloaded it from here and installed it on my machine: <a href="http://sourceforge.net/projects/scipy/files/scipy/0.10.1/scipy-0.10.1-py2.7-python.org-macosx10.6.dmg/download">http://sourceforge.net/projects/scipy/files/scipy/0.10.1/scipy-0.10.1-py2.7-python.org-macosx10.6.dmg/download</a><br>
 <br>Thanks for helping get to the bottom of this error- lemme know what you suggest!<br><br>Best,<br>Bruna<br><br><div class="gmail_quote">On Wed, Sep 19, 2012 at 5:00 AM,  <span dir="ltr"><<a href="mailto:pkg-exppsy-pymvpa-request@lists.alioth.debian.org" target="_blank">pkg-exppsy-pymvpa-request@lists.alioth.debian.org</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">Send Pkg-ExpPsy-PyMVPA mailing list submissions to<br>
        <a href="mailto:pkg-exppsy-pymvpa@lists.alioth.debian.org">pkg-exppsy-pymvpa@lists.alioth.debian.org</a><br>
<br>
To subscribe or unsubscribe via the World Wide Web, visit<br>
        <a href="http://lists.alioth.debian.org/cgi-bin/mailman/listinfo/pkg-exppsy-pymvpa" target="_blank">http://lists.alioth.debian.org/cgi-bin/mailman/listinfo/pkg-exppsy-pymvpa</a><br>
<br>
or, via email, send a message with subject or body 'help' to<br>
        <a href="mailto:pkg-exppsy-pymvpa-request@lists.alioth.debian.org">pkg-exppsy-pymvpa-request@lists.alioth.debian.org</a><br>
<br>
You can reach the person managing the list at<br>
        <a href="mailto:pkg-exppsy-pymvpa-owner@lists.alioth.debian.org">pkg-exppsy-pymvpa-owner@lists.alioth.debian.org</a><br>
<br>
When replying, please edit your Subject line so it is more specific<br>
than "Re: Contents of Pkg-ExpPsy-PyMVPA digest..."<br>
<br>
<br>
Today's Topics:<br>
<br>
   1. Re: Eyetracking analyses in PyMVPA (Michael Hanke)<br>
   2. Re: Eyetracking analyses in PyMVPA (Michael Hanke)<br>
<br>
<br>
----------------------------------------------------------------------<br>
<br>
Message: 1<br>
Date: Wed, 19 Sep 2012 13:16:10 +0200<br>
From: Michael Hanke <<a href="mailto:mih@debian.org">mih@debian.org</a>><br>
To: Development and support of PyMVPA<br>
        <<a href="mailto:pkg-exppsy-pymvpa@lists.alioth.debian.org">pkg-exppsy-pymvpa@lists.alioth.debian.org</a>><br>
Subject: Re: [pymvpa] Eyetracking analyses in PyMVPA<br>
Message-ID: <20120919111610.GI24222@meiner><br>
Content-Type: text/plain; charset=us-ascii<br>
<br>
Hi,<br>
<br>
I'm CC'ing Florian, who contributed these examples originally -- maybe<br>
he has some ideas...<br>
<br>
<br>
Cheers,<br>
<br>
Michael<br>
<br>
<br>
On Mon, Sep 17, 2012 at 03:53:36PM -0700, Bruna Martins wrote:<br>
> Hi There,<br>
><br>
> I am a complete newbie to PyMVPA, and currently doing an eyetracking study.<br>
> I'm currently navigating the eyetracking tutorial, but wanted to get your<br>
> pearls as well- thanks for your patience in advance.  My study has a<br>
> within-subjects design, where each trial is either condition A or B, and<br>
> we're looking at gaze differences between the conditions. Stimuli are<br>
> randomly presented either on the left or the right side of the screen, so<br>
> the analysis is a little complex . I am hoping to do two different things:<br>
><br>
> 1. Input difference scores between  (Xcoord- Xcenter)  and (Ycoord-<br>
> Ycenter) for each trial- there will be a different number of trackable<br>
> instances for each timepoint (depending on whether track was lost, blink<br>
> frequency, etc) to predict condition A vs B<br>
><br>
> 2. Input a scalar value indicating the percentage of time spent within the<br>
> stimulus area of interest on the screen (ie, 0.70 = on the stimulus for 70%<br>
> on stimulus), for each trial, and again predict whether the trial was of<br>
> condition A or B, but this time have one value per trial<br>
><br>
> I was wondering how you would recommend approaching the two analyses<br>
> outlined above.<br>
><br>
> Thanks so much for your help,<br>
> Bruna Martins<br>
><br>
><br>
> --<br>
> *Bruna S. Martins*<br>
> *<br>
> *<br>
> Ph.D. Student- Clinical Psychology<br>
> Emotion & Cognition Lab- Gero 341<br>
> University of Southern California<br>
> (213) 821- 5701<br>
<br>
> _______________________________________________<br>
> Pkg-ExpPsy-PyMVPA mailing list<br>
> <a href="mailto:Pkg-ExpPsy-PyMVPA@lists.alioth.debian.org">Pkg-ExpPsy-PyMVPA@lists.alioth.debian.org</a><br>
> <a href="http://lists.alioth.debian.org/cgi-bin/mailman/listinfo/pkg-exppsy-pymvpa" target="_blank">http://lists.alioth.debian.org/cgi-bin/mailman/listinfo/pkg-exppsy-pymvpa</a><br>
<br>
<br>
--<br>
Michael Hanke<br>
<a href="http://mih.voxindeserto.de" target="_blank">http://mih.voxindeserto.de</a><br>
<br>
<br>
<br>
------------------------------<br>
<br>
Message: 2<br>
Date: Wed, 19 Sep 2012 13:18:03 +0200<br>
From: Michael Hanke <<a href="mailto:mih@debian.org">mih@debian.org</a>><br>
To: Development and support of PyMVPA<br>
        <<a href="mailto:pkg-exppsy-pymvpa@lists.alioth.debian.org">pkg-exppsy-pymvpa@lists.alioth.debian.org</a>><br>
Subject: Re: [pymvpa] Eyetracking analyses in PyMVPA<br>
Message-ID: <20120919111802.GJ24222@meiner><br>
Content-Type: text/plain; charset=us-ascii<br>
<br>
On Mon, Sep 17, 2012 at 04:26:55PM -0700, Bruna Martins wrote:<br>
> I tried out the eyetracking tutorial, and ran into an error when running<br>
> the down-sampling step:<br>
><br>
> >>> ds = fft_resample(raw_ds, 100, window='hann',<br>
> ...                   chunks_attr='trial', attr_strategy='sample')<br>
> python(2418) malloc: *** error for object 0x7fbad35fc008: incorrect<br>
> checksum for freed object - object was probably modified after being freed.<br>
> *** set a breakpoint in malloc_error_break to debug<br>
> Abort trap: 6<br>
<br>
This looks like something in SciPy is exploding. Can you give some mre<br>
details on your system, what version of Scipy, how you installed it...<br>
<br>
Michael<br>
<br>
--<br>
Michael Hanke<br>
<a href="http://mih.voxindeserto.de" target="_blank">http://mih.voxindeserto.de</a><br>
<br>
<br>
<br>
------------------------------<br>
<br>
_______________________________________________<br>
Pkg-ExpPsy-PyMVPA mailing list<br>
<a href="mailto:Pkg-ExpPsy-PyMVPA@lists.alioth.debian.org">Pkg-ExpPsy-PyMVPA@lists.alioth.debian.org</a><br>
<a href="http://lists.alioth.debian.org/cgi-bin/mailman/listinfo/pkg-exppsy-pymvpa" target="_blank">http://lists.alioth.debian.org/cgi-bin/mailman/listinfo/pkg-exppsy-pymvpa</a><br>
<br>
End of Pkg-ExpPsy-PyMVPA Digest, Vol 55, Issue 15<br>
*************************************************<br>
</blockquote></div><br><br clear="all"><br>-- <br><div><b>Bruna S. Martins</b><div><b><br></b><div><div><div>Ph.D. Student- Clinical Psychology</div><div>Emotion & Cognition Lab- Gero 341</div><div><div>University of Southern California</div>
<div>(213) 821- 5701<br></div></div></div></div></div></div><br>
</div>