<div dir="ltr">MyData is structural MRI data coming from fmri_dataset function. There are two chunks, and similar to clf.predictions (in tutorial), I'm wondering whether I can get each predicted label, because I want to compare AUC in R.<div>
<br></div><div style>Thanks</div><div style>Arman</div></div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">On Fri, Jan 31, 2014 at 8:48 PM, Yaroslav Halchenko <span dir="ltr"><<a href="mailto:debian@onerussian.com" target="_blank">debian@onerussian.com</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div class="HOEnZb"><div class="h5"><br>
On Fri, 31 Jan 2014, Arman Eshaghi wrote:<br>
<br>
>    Dear all,<br>
>    I have the following�snippet� and�according�to documentations I can get<br>
>    different statistics from 'results' object.�<br>
>    However, I was wondering how I can get individual (subject by subject)<br>
<br>
<br>
>    labels, or in other word how I can see the predictions for each subject?�<br>
>    Hopefully I will add it somewhere in�documentation�for posterity.<br>
>    All the best,<br>
>    Arman<br>
>    � �baseclf= LinearNuSVMC(nu=0.3)<br>
>    � �metaclf=MappedClassifier(baseclf, SVDMapper())<br>
>    � �cvte=CrossValidation(metaclf, HalfPartitioner(attr='chunks'),<br>
>    errorfx=lambda p, t: np.mean(p == t), � � �enable_ca=['stats'])<br>
>    � �results=cvte(MyData)<br>
>    #cvte.predictions() does not work<br>
<br>
</div></div>and your MyData is the one containing the subjects or where do they<br>
come? (not sure since you do partitioning still based on chunks<br>
attribute not e.g. based on 'subjects' ;-) )<br>
<span class="HOEnZb"><font color="#888888"><br>
--<br>
Yaroslav O. Halchenko, Ph.D.<br>
<a href="http://neuro.debian.net" target="_blank">http://neuro.debian.net</a> <a href="http://www.pymvpa.org" target="_blank">http://www.pymvpa.org</a> <a href="http://www.fail2ban.org" target="_blank">http://www.fail2ban.org</a><br>

Senior Research Associate,     Psychological and Brain Sciences Dept.<br>
Dartmouth College, 419 Moore Hall, Hinman Box 6207, Hanover, NH 03755<br>
Phone: <a href="tel:%2B1%20%28603%29%20646-9834" value="+16036469834">+1 (603) 646-9834</a>                       Fax: <a href="tel:%2B1%20%28603%29%20646-1419" value="+16036461419">+1 (603) 646-1419</a><br>
WWW:   <a href="http://www.linkedin.com/in/yarik" target="_blank">http://www.linkedin.com/in/yarik</a><br>
<br>
_______________________________________________<br>
Pkg-ExpPsy-PyMVPA mailing list<br>
<a href="mailto:Pkg-ExpPsy-PyMVPA@lists.alioth.debian.org">Pkg-ExpPsy-PyMVPA@lists.alioth.debian.org</a><br>
<a href="http://lists.alioth.debian.org/cgi-bin/mailman/listinfo/pkg-exppsy-pymvpa" target="_blank">http://lists.alioth.debian.org/cgi-bin/mailman/listinfo/pkg-exppsy-pymvpa</a></font></span></blockquote></div><br></div>