<div dir="ltr">Thanks!  apt-get worked perfectly.  <div><br></div><div>Cheers,</div><div>Jason</div><div><br></div></div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">On Mon, Feb 10, 2014 at 8:32 PM, Yaroslav Halchenko <span dir="ltr"><<a href="mailto:debian@onerussian.com" target="_blank">debian@onerussian.com</a>></span> wrote:<br>

<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">are you using 32bit or 64bit NeuroDebian VM?  just use 64bit, give it<br>
more memory and be happy:  apt-get install python-mvpa2 would install<br>
64bit build since the entire Debian system will be 64bit build ;-)<br>
<br>
alternative/complimentary, if you are loading .nii.gz files (wasn't<br>
disclosed) -- you might also try to uncompress them, and construct<br>
dataset from .nii instead of .nii.gz .  At least for the moment they are<br>
'original', i.e. not yet masked, nibabel would memmap them instead of<br>
loading into memory from the compressed .gz.<br>
<br>
hope this helps<br>
<div><div class="h5"><br>
On Mon, 10 Feb 2014, Jason Ozubko wrote:<br>
<br>
>    Hello,<br>
>    I am trying to load a rather large dataset to do some exploration and I'm<br>
>    running into memory errors. �I am using the NeuroDebian virtual machine<br>
>    with 4GB of RAM assigned to it. �My computer is a 64-bit Windows 7 machine<br>
>    with 12GB of RAM and so, in theory, if I could load a 64-bit version of<br>
>    PyMVPA, I thought I could overcome these memory issues.<br>
>    Unfortunately all attempts to do so have failed. �I tried getting python<br>
>    and the necessary libraries installed on my Windows 7 environment but<br>
>    attempts to build PyMVPA fail unless I use a 32-bit version of python.<br>
>    �Does anyone know if it's even possible to compile a 64-bit version PyMVPA<br>
>    or else alternatively, are there other tricks that can be used to overcome<br>
>    memory limitations in pyhton and PyMVPA?<br>
>    Thanks in advance<br>
>    Cheers,<br>
>    Jason<br>
<br>
</div></div>> _______________________________________________<br>
> Pkg-ExpPsy-PyMVPA mailing list<br>
> <a href="mailto:Pkg-ExpPsy-PyMVPA@lists.alioth.debian.org">Pkg-ExpPsy-PyMVPA@lists.alioth.debian.org</a><br>
> <a href="http://lists.alioth.debian.org/cgi-bin/mailman/listinfo/pkg-exppsy-pymvpa" target="_blank">http://lists.alioth.debian.org/cgi-bin/mailman/listinfo/pkg-exppsy-pymvpa</a><br>
<span class="HOEnZb"><font color="#888888"><br>
<br>
--<br>
Yaroslav O. Halchenko, Ph.D.<br>
<a href="http://neuro.debian.net" target="_blank">http://neuro.debian.net</a> <a href="http://www.pymvpa.org" target="_blank">http://www.pymvpa.org</a> <a href="http://www.fail2ban.org" target="_blank">http://www.fail2ban.org</a><br>


Senior Research Associate,     Psychological and Brain Sciences Dept.<br>
Dartmouth College, 419 Moore Hall, Hinman Box 6207, Hanover, NH 03755<br>
Phone: <a href="tel:%2B1%20%28603%29%20646-9834" value="+16036469834">+1 (603) 646-9834</a>                       Fax: <a href="tel:%2B1%20%28603%29%20646-1419" value="+16036461419">+1 (603) 646-1419</a><br>
WWW:   <a href="http://www.linkedin.com/in/yarik" target="_blank">http://www.linkedin.com/in/yarik</a><br>
<br>
_______________________________________________<br>
Pkg-ExpPsy-PyMVPA mailing list<br>
<a href="mailto:Pkg-ExpPsy-PyMVPA@lists.alioth.debian.org">Pkg-ExpPsy-PyMVPA@lists.alioth.debian.org</a><br>
<a href="http://lists.alioth.debian.org/cgi-bin/mailman/listinfo/pkg-exppsy-pymvpa" target="_blank">http://lists.alioth.debian.org/cgi-bin/mailman/listinfo/pkg-exppsy-pymvpa</a></font></span></blockquote></div><br></div>