<div dir="ltr">On 22 August 2014 13:47, Ben Acland <span dir="ltr"><<a href="mailto:benacland@gmail.com" target="_blank">benacland@gmail.com</a>></span> wrote:<br><div class="gmail_extra"><div class="gmail_quote"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex">
Is there a way to run permutation testing using multiple processes?<br></blockquote><div><br></div><div>Not at the moment, as far as I know.</div><div><br></div><div>Currently we have parallelization in the searchlight and some of the surface-based voxel selection code, but the code is non-unified.  A while ago I proposed a more unified parallellization approach:</div>
<div><br></div><div><a href="https://github.com/PyMVPA/PyMVPA/pull/109">https://github.com/PyMVPA/PyMVPA/pull/109</a><br></div><div><br></div><div>but it would require extensive testing before it could be merged into master.</div>
<div><br></div><div>If I remember correctly, some things broke when trying to parallelize repeated measures because of conditional attributes that were not properly passed through when pickling / hd5-ing the data. I don't know how this would play out for the MC code...</div>
<div><br></div><div>Once we get to looking into the parallelization stuff, I'll try to make sure we have a look at the MC code as well.</div><div><br></div><div><br></div></div></div></div>