<div dir="ltr"><div>Okay, the dataset is pretty big, about 90mb not sure how I would upload it.<br><br></div>Yeah, the resulting dataset that is returned by from_wizard is empty but of the correct shape.<br></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Thu, Dec 4, 2014 at 7:23 PM, Yaroslav Halchenko <span dir="ltr"><<a href="mailto:debian@onerussian.com" target="_blank">debian@onerussian.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><span class=""><br>
On Thu, 04 Dec 2014, Thomas Nickson wrote:<br>
<br>
>    The mask is of type dtype=uint8 for the wizard and unspecified array for<br>
>    the fmri.<br>
>    I have loaded it from the original nifti and the fmri loader works fine.<br>
>    Is it okay to use it like this? Or will I run in to trouble?<br>
<br>
>    The mask for Dataset.from_wizard is just assembled by getImageData(MASK)<br>
>    (which isn't very consistent) and it generates zeros. Is this correct?<br>
<br>
>    For Dataset.from_wizard I tried loading it from the NIFTI but again I get<br>
>    an error.<br>
>    I think this is bug right?<br>
<br>
</span>could well be... but confused a bit -- in above "it generates zeros" you<br>
refer to our dataset's from_wizard not your getImageData  right?<br>
<br>
the best would be if you could just share that data you are trying to<br>
feed into from_wizard() call (just h5save a dictionary with them)<br>
<span class="HOEnZb"><font color="#888888"><br>
--<br>
Yaroslav O. Halchenko, Ph.D.<br>
<a href="http://neuro.debian.net" target="_blank">http://neuro.debian.net</a> <a href="http://www.pymvpa.org" target="_blank">http://www.pymvpa.org</a> <a href="http://www.fail2ban.org" target="_blank">http://www.fail2ban.org</a><br>
Research Scientist,            Psychological and Brain Sciences Dept.<br>
Dartmouth College, 419 Moore Hall, Hinman Box 6207, Hanover, NH 03755<br>
Phone: <a href="tel:%2B1%20%28603%29%20646-9834" value="+16036469834">+1 (603) 646-9834</a>                       Fax: <a href="tel:%2B1%20%28603%29%20646-1419" value="+16036461419">+1 (603) 646-1419</a><br>
WWW:   <a href="http://www.linkedin.com/in/yarik" target="_blank">http://www.linkedin.com/in/yarik</a><br>
</font></span><div class="HOEnZb"><div class="h5"><br>
_______________________________________________<br>
Pkg-ExpPsy-PyMVPA mailing list<br>
<a href="mailto:Pkg-ExpPsy-PyMVPA@lists.alioth.debian.org">Pkg-ExpPsy-PyMVPA@lists.alioth.debian.org</a><br>
<a href="http://lists.alioth.debian.org/cgi-bin/mailman/listinfo/pkg-exppsy-pymvpa" target="_blank">http://lists.alioth.debian.org/cgi-bin/mailman/listinfo/pkg-exppsy-pymvpa</a><br>
</div></div></blockquote></div><br></div>