<div dir="ltr">Hi,<div><br></div><div>On Tue, Dec 16, 2014 at 9:33 AM, gal star <span dir="ltr"><<a href="mailto:gal.star3051@gmail.com" target="_blank">gal.star3051@gmail.com</a>></span> wrote:<br></div><div class="gmail_extra"><div class="gmail_quote"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Hello all,<div>Is there a way to speed up the loading of a Nifti file </div><div>using fmri_dataset?</div><div><br></div><div>I'm running mvpa script on a 16 core machine.</div><div>Having a 3080 scans concanated into single Nifti file.</div><div><br></div><div>According to time measurements, It could take up to 20 min </div><div>(only fmri_dataset command). I've also noticed it runs on a single core.</div><div><br></div><div>Is there a way, similar to searchlight method, to use more than one core </div><div>for the mission of loading - hence, speeding the time it takes?</div></div></blockquote><div><br></div><div>What fmri_dataset() is doing is  essentially IO bound. Adding multiple cores doesn't make things faster.</div><div><br></div><div>Are you pulling data over the network (NFS?)? How large is it (the number of volumes doesn't matter much).</div><div><br></div><div>Michael</div><div><br></div></div>
</div></div>