<div dir="ltr"><div style="font-size:12.8000001907349px"><div><div>Dear All,<br><br></div>Hello!  I am in the middle of setting up a rapid event-related design analysis, and was hoping I could ask a few questions.  I've been working through this for a while, but to no avail.  Thanks in advance! <br><br>My main confusion(s) stem from the fact that my design has events that are not multiples of the TR.  Namely, there are 110 events (of 3s duration), but my TR is 2s.  So, technically, any volume could have multiple conditions, and/or conditions can spread over more than one TR.  What is the best way of dealing with this when setting up the analysis?  <br><br></div><div>1.  <span>PyMVPA</span> knows that my nifti file has 179 volumes, so it keeps getting mad when I try to create an attribute that has fewer items (say, a condition for each of the 110 events).  How can I make the software forget about the volumes and just focus on the timepoints of my events?  The original attribute file (with just chunks and condition) has to be 179 items long, but 110 doesn't fit into 179 very nicely!  :)<br></div><div><br></div>2. I am trying to get GLM estimates (per event/volume) using 'eventrelated_design' with 'hrf'.  I understand that it is possible to bring in betas from outside<span>PyMVPA</span>, but I was hoping to keep it all "in house."  Even if I make my event list by multiplying by TR (as in the tutorial), the original dataset need is still 179 volumes, so the events and attributes don't line up.<br><br></div><div style="font-size:12.8000001907349px">3.  I find that my "time_coords" are always blank (all zeros) when I create my datasets, but several functions seem to require this information.  Similarly, the time_indices are always 179 due to the nifti volumes, but that's not very useful for me (again, 110 events, sorry to be repetitive).<br><br></div><div style="font-size:12.8000001907349px">Lastly (I hope!), is it possible using eventrelated_dataset to get parameters for each event (instead of each target)?  I was hoping to be able to tease apart relationships at an event by event basis.<br><br><br></div><div style="font-size:12.8000001907349px">Thank you all very much for your time!<br><br></div><div style="font-size:12.8000001907349px">Cheers,<br></div><div style="font-size:12.8000001907349px">Jeff</div></div>