
<html>


<head>


<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8">


</head>


<body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; color: rgb(0, 0, 0); font-size: 14px; font-family: 宋体, sans-serif;">


<div>


<p style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif; font-size: 12.8px; widows: 1; background-color: rgb(255, 255, 255);">


Dear PyMVPAer,</p>


<p style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif; font-size: 12.8px; widows: 1; background-color: rgb(255, 255, 255);">


I am a newbie for PyMVPA, and was trying to do pattern analysis on my EEG data, but was experiencing a problem about the module LinearCSVMC. It will be very appreciated if some one could offer me some help. <br>


</p>


<p style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif; font-size: 12.8px; widows: 1; background-color: rgb(255, 255, 255);">


I am using mac Yosemite v10.10.5. I setup the PyMVPA from the source according to the installation tutorial exactly. Everything goes well until I tried to use LinearCSVMC classifier. It returns, "name ‘LinearCSVMC’ is not defined”. <br>


</p>


<p style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif; font-size: 12.8px; widows: 1; background-color: rgb(255, 255, 255);">


I searched the mail list record, and found there is a thread about the same issue. <br>


</p>


<p style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif; font-size: 12.8px; widows: 1; background-color: rgb(255, 255, 255);">


<a href="http://lists.alioth.debian.org/pipermail/pkg-exppsy-pymvpa/2015q3/003173.html" target="_blank" style="color: rgb(17, 85, 204);">http://lists.alioth.debian.<wbr>org/pipermail/pkg-exppsy-<wbr>pymvpa/2015q3/003173.html</a></p>


<p style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif; font-size: 12.8px; widows: 1; background-color: rgb(255, 255, 255);">


It seems like the swig version causing this problem, so I used macport to downgrade my swig from 3.0.7 to 3.0.2, but it does not work neither. <br>


</p>


<p style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif; font-size: 12.8px; widows: 1; background-color: rgb(255, 255, 255);">


I reinstalled the PyMVPA and saw warnings and errors, but I am not sure if they caused this problem. <br>


</p>


<p style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif; font-size: 12.8px; widows: 1; background-color: rgb(255, 255, 255);">


In the step ‘python setup.py build_ext’, it has,<br>


</p>


<blockquote style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif; font-size: 12.8px; widows: 1; margin: 0px 0px 0px 40px; border: none; padding: 0px; background-color: rgb(255, 255, 255);">


<p>#### ['/usr/bin/clang', '-fno-strict-aliasing', '-fno-common', '-dynamic', '-pipe', '-Os', '-fwrapv', '-DNDEBUG', '-g', '-fwrapv', '-O3', '-Wall', '-Wstrict-prototypes'] #######</p>


<p>Missing compiler_cxx fix for UnixCCompiler</p>


</blockquote>


<p style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif; font-size: 12.8px; widows: 1; background-color: rgb(255, 255, 255);">


In the step ‘python setup.py install’, it has,<br>


</p>


<blockquote style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif; font-size: 12.8px; widows: 1; margin: 0px 0px 0px 40px; border: none; padding: 0px; background-color: rgb(255, 255, 255);">


<p>package init file 'mvpa2/tests/badexternals/__<wbr>init__.py' not found (or not a regular file)</p>


<p>package init file 'mvpa2/tests/badexternals/__<wbr>init__.py' not found (or not a regular file)</p>


<p>#### ['/usr/bin/clang', '-fno-strict-aliasing', '-fno-common', '-dynamic', '-pipe', '-Os', '-fwrapv', '-DNDEBUG', '-g', '-fwrapv', '-O3', '-Wall', '-Wstrict-prototypes'] #######</p>


<p>Missing compiler_cxx fix for UnixCCompiler</p>


</blockquote>


<p style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif; font-size: 12.8px; widows: 1; background-color: rgb(255, 255, 255);">


</p>


<p style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif; font-size: 12.8px; widows: 1; background-color: rgb(255, 255, 255);">


</p>


<p style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif; font-size: 12.8px; widows: 1; background-color: rgb(255, 255, 255);">


Also, when I was trying to use PyMVPA in iPython, it is very strange to see that ipython returns ’no module named mvpa2’, but in python, mvpa2 can be successfully loaded. <br>


</p>


<p style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif; font-size: 12.8px; widows: 1; background-color: rgb(255, 255, 255);">


<span style="font-size: 12.8px;">Thank you very much for any helps or advises!</span></p>


<p style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif; font-size: 12.8px; widows: 1; background-color: rgb(255, 255, 255);">


<span style="background-color: rgb(255, 254, 254); font-size: 12.8px;">Carl</span></p>


</div>


<div>


<div id="MAC_OUTLOOK_SIGNATURE"></div>


</div>


</body>


</html>