<div dir="ltr"><div class="gmail_default" style="font-family:garamond,serif;font-size:large;color:rgb(0,0,0)"><div class="gmail_default">Hi, I am computing the similarity between the activation maps of 2 conditions within a frontoparietal mask using the code below,</div><div class="gmail_default">, and, for each individual subject. I am getting correlation values higher than 1, see output list at the bottom, however I understand these should range between 0 (identical) to 1 (uncorrelated)? </div><div class="gmail_default">Any advise is appreciated</div><div class="gmail_default">thanks!</div><div class="gmail_default">david</div><div class="gmail_default"><br></div><div class="gmail_default"><br></div><div class="gmail_default">ps=[0, 1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13, 14,15,16,17,18]</div><div class="gmail_default"><br></div><div class="gmail_default">resultado=[] </div><div class="gmail_default">from mvpa2.mappers.detrend import poly_detrend </div><div class="gmail_default"> </div><div class="gmail_default">for subj in ps:</div><div class="gmail_default">    ds = fmri_dataset(samples=os.path.join(datapath, 's.i.pred%d.nii.gz')%(int(subj)),</div><div class="gmail_default">                      targets=attr.targets, chunks=attr.chunks,</div><div class="gmail_default">                      mask=os.path.join(datapathmask, 'mask.nii.gz'),#based on FEAT analyses</div><div class="gmail_default">                      add_fa={'cluster_searchpred': os.path.join(datapath1, 'cluster_searchpred.nii.gz')})     </div><div class="gmail_default"><br></div><div class="gmail_default">    from mvpa2.measures import rsa</div><div class="gmail_default">    rsa_xsubj = rsa.PDist(square=True) </div><div class="gmail_default">    res = rsa_xsubj(ds) </div><div class="gmail_default">    resul=res.S[0,1]</div><div class="gmail_default">    resultado.append(res.S[0,1])<br></div><div class="gmail_default">----></div><div class="gmail_default"><div class="gmail_default">0.60377539435397509,</div><div class="gmail_default"> 0.61374525419685622,</div><div class="gmail_default"> 1.1142951914849382,</div><div class="gmail_default"> 0.97604011146884972,</div><div class="gmail_default"> 0.49202801554753195,</div><div class="gmail_default"> 0.77693568183436723,</div><div class="gmail_default"> 1.1792308174154826,</div><div class="gmail_default"> 0.79977620949819672,</div><div class="gmail_default"> 0.82386196165868597,</div><div class="gmail_default"> 0.73430209533220103,</div><div class="gmail_default"> 0.75513093298950229,</div><div class="gmail_default"> 1.0864677653799166,</div><div class="gmail_default"> 1.0623285688583259,</div><div class="gmail_default"> 0.97273572366115335,</div><div class="gmail_default"> 0.96046313836217112,</div><div class="gmail_default"> 0.2798419853674019,</div><div class="gmail_default"> 0.85927153773083831,</div><div class="gmail_default"> 1.6251078728068848,</div><div class="gmail_default"> 0.44645101975074164,</div></div><div class="gmail_default">     <br></div></div></div>