<div dir="ltr">Hi Juan,<div><br></div><div>in my experience macports (and homebrew) don't play that nicely with Python. The best solution I found is using conda. I would suggest removing your python installation from macports, and install everything with conda.</div><div><br></div><div>Matteo<br></div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Fri, Aug 26, 2016 at 3:06 AM, Juan Dominguez <span dir="ltr"><<a href="mailto:juan.dominguez@monash.edu" target="_blank">juan.dominguez@monash.edu</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Hi amigos,<br><br>I am trying to install PyMVPA on my macbook pro (OS X 10.9.5) but I'm having some trouble compiling it. I am getting the following error on the terminal:<br><br>sudo port install py27-pymvpa +scipy +nibabel +hcluster +libsvm +matplotlib +pywavelet<br>---> Computing dependencies for py27-pymvpa<br>---> Building py27-pymvpa<br>Error: org.macports.build for port py27-pymvpa returned: command execution failed<br><br>--end of error---<br><br>Here's also a relevant excerpt from the log file:<br><br>:info:build Exit code: 1<br>:error:build org.macports.build for port py27-pymvpa returned: command execution failed<br>:debug:build Error code: CHILDSTATUS 2442 1<br>:debug:build Backtrace: command execution failed<br>while executing<br>"system -nice 0 $fullcmdstring"<br>("eval" body line 1)<br>invoked from within<br>"eval system $notty $nice \$fullcmdstring"<br>invoked from within<br>"command_exec build"<br>(procedure "portbuild::build_main" line 8)<br>invoked from within<br>"portbuild::build_main org.macports.build"<br>("eval" body line 1)<br>invoked from within<br>"eval $procedure $targetname"<br>:info:build Warning: targets not executed for py27-pymvpa: org.macports.activate org.macports.buildorg.<wbr>macports.destroot org.macports.install<br><br>--end of excerpt---<br><br>I've installed Xcode and command line tools as well as macports. I have also checked the path in the bash_profile file to be:<div><br>export PATH="/opt/local/bin:/opt/<wbr>local/sbin:$PATH"<br><br>I'm using Mavericks and cannot update to El Capitan because I am using a key application that has no El Capitan update yet.<br><br>Your help with this issue is very much appreciated.<br><br>Best,<br><br>Juan<div><br></div><div data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div>
</div></div>
<br>______________________________<wbr>_________________<br>
Pkg-ExpPsy-PyMVPA mailing list<br>
<a href="mailto:Pkg-ExpPsy-PyMVPA@lists.alioth.debian.org">Pkg-ExpPsy-PyMVPA@lists.<wbr>alioth.debian.org</a><br>
<a href="http://lists.alioth.debian.org/cgi-bin/mailman/listinfo/pkg-exppsy-pymvpa" rel="noreferrer" target="_blank">http://lists.alioth.debian.<wbr>org/cgi-bin/mailman/listinfo/<wbr>pkg-exppsy-pymvpa</a><br></blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div style="font-size:12.8px">Matteo Visconti di Oleggio Castello<br>Ph.D. Student in Cognitive Neuroscience<br>Dartmouth College<br><br><span title="Call with Google Voice">+1 (603) 646-8665</span></div><div style="font-size:12.8px"><a href="http://www.mvdoc.me/" target="_blank">mvdoc.me</a> || <a href="http://linkedin.com/in/matteovisconti" target="_blank">linkedin.com/in/matteovisconti</a> || <a href="http://github.com/mvdoc" target="_blank">github.com/mvdoc</a></div></div></div>
</div>