<div dir="ltr"><div class="gmail_default" style="font-family:georgia,serif"><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:12.8px">Hi all, </span><div style="font-family:arial,sans-serif;font-size:12.8px"><br></div><div style="font-family:arial,sans-serif;font-size:12.8px">I am a relatively new pyMVPA user and have 2 questions.</div><div style="font-family:arial,sans-serif;font-size:12.8px"><br></div><div style="font-family:arial,sans-serif;font-size:12.8px">1) </div><blockquote style="font-family:arial,sans-serif;font-size:12.8px;margin:0px 0px 0px 40px;border:none;padding:0px"><div>I'm working with 10 chunks of data (190 rows each) with 6 classes + baseline and am looking to classify them using a linear classifier however my results are <50%. I think there's something wrong with how I may be setting this up. Being that this is a rapid-event design, I'm looking to classify groups of voxel activity to their respective classes. In the tutorial, I use a zscored and polydetrended dataset and apply:</div><div><br></div><div><font face="monospace, monospace">clf = LinearCSVMC()</font></div><div><font face="monospace, monospace">cvte = CrossValidation(clf, NFoldPartitioner(), </font></div><div><font face="monospace, monospace">            errorfx= lambda p,t: np.mean(p==t),enable_ca=['<wbr>stats'])</font></div><div><font face="monospace, monospace">cv_results = cvte(df)</font></div><div><br></div><div><br></div><div><b>However, </b>since this is an event based task (where the subject's answer is placed into a certain class), shouldn't I instead be looking to do an event-related analysis, shown in : <a href="http://www.pymvpa.org/tutorial_eventrelated.html" target="_blank">http://www.pymvpa.org/<wbr>tutorial_eventrelated.html</a> ? Here, would I first do some response modeling via fitting a hemodynamic response model? If so, how does this fit into my pattern classification?</div></blockquote><div style="font-family:arial,sans-serif;font-size:12.8px"><br></div><blockquote style="font-family:arial,sans-serif;font-size:12.8px;margin:0px 0px 0px 40px;border:none;padding:0px">Any clarification regarding these steps would be appreciated.</blockquote><div style="font-family:arial,sans-serif;font-size:12.8px"><div><br></div><div>2)  </div></div><blockquote style="font-family:arial,sans-serif;font-size:12.8px;margin:0px 0px 0px 40px;border:none;padding:0px">My final goal after classifying neuronal activity is to then have a map for each class. Is this the same as doing a sensitivity mapping with the pyMVPA functions for this? </blockquote><div style="font-family:arial,sans-serif;font-size:12.8px"><div><br></div><div><br></div><div>Thank you, </div><br><div class="gmail-m_414721515724674450gmail_signature"><div dir="ltr">Anaelia Ovalle</div></div></div></div><div><br></div><div class="gmail_signature"><br></div>
</div>